Quando você tenta transmitir um cupom fiscal e a emissão não for concluída, a nota ficará com uma bolinha vermelha identificando que a nota não foi transmitida. Isso acontece por vários fatores: erro no cadastro dos produtos, site da sefaz fora de serviço, etc.
E se não teve tempo de emitir no mesmo dia, você poderá concluir em outro dia (dentro do mês corrente), usando o Financeiro
1. Entre no módulo Financeiro e clique em Notas fiscais